Обстоятельства и особенности:
До 50% рождающихся в России детей - имеют те или иные отклонения, в 35% случаев данные врожденные нарушения - генетической природы,
15% патологий - наследуемого характера, среди больных детей до трети не проходят по 5-ти летней выживаемости
Из более чем 7 000 генетических патологий наиболее часто встречается ~ 400, до 50% данных заболеваний не проявляются при определенном стечении факторов,
либо их можно перевести в относительно легкие формы / сдвинуть развитие на поздние сроки
Для 7% выявляемых врожденных заболеваний - отсутствует адекватный диагностикум (нет достаточной и простой базы знаний для методичного выявления и последующей терапии)
По 50% врожденных патологий - нет специализированных фондов, общественных организаций, профессиональных объединений (каждая семья решает свои проблемы, по сути, сама)
Крайне важно - диагностировать заболевание, в полном объеме, с максимальной детализацией, и вовремя - чтобы в итоге помочь ребенку жить - здесь все зависит от усилий родителей
Специфика врожденных заболеваний
что важно учитывать:
![](../assets/images/dist/ydvbd-ab1.webp)
По ОМС новорожденные (если заболевание не выявлено пренатально или раньше - у родителей на стадии планирования беременности)
тестируются только по 5 видам наследуемых заболеваний; в Москве - еще по 6,
в отдельных регионах - еще по 3-4, то есть в лучшем случае - проверка идет по 5-11 заболеваниям,
тогда как по и опыту желательно вести проверки хотя бы по 70-80, и даже этого - мало, т.к. подобные анализы недостаточно достоверны.
Выявляемость на примере муковисцидоза - по статистике встречаемость в РФ
у малышей - 1:10 000, по скринингам - 1:8 000; по тяжелым и средним формам 1:5 600,
по всем формам истинная встречаемость - 100:10 000; до 35% больных выявляются в первые дни, до 30% - в течение 2 лет,
35% - не выявляются - но входят в группу риска - и это не считая тех, у кого слабые (что тоже опасно!) формы патологии
Проверяемые (при неонатальном "пяточном тесте") патологии по ОМС: адреногенитальный
синдром, врожденный гипотиреоз, галактоземия, фенилкетонурия, муковисцидоз
Дополнительно по Москве: глутаровая ацидурия I типа, тирозинемизия I типа, лейциноз, метилмалоновая/пропионовая ацидурия,
недостаточность биотинидазы, недостаточность ацил-КоА-дегидрогеназы СЦЖК
В 2023-24 гг планировалось расширить список проверяемых по ОМС врожденных патологий на неонатальном уровне
до 36 - когда это действительно произойдет - мало что изменится, т.к. список все равно недостаточен и эффективность
скрининга - крайне скромная (в среднем - выявляемость 0,06% - минимум в 120 раз ниже, чем требуется)
Приведенный выше пример по муковисцидозу - относительно прост - заболевание возникает при поломке всего 1 гена
(CFTR, расположен на длинном плече 7-й хромосомы), наследуется по классической аутосомно-рецессивной схеме
(ребенок получает обе "половинки" повреждённого гена от родителей), но даже при такой понятной картине -
известно 3 494 (!) мутации по данному гену, минимум 7 форм течения заболевания (совершенно разных во всем),
при диагностике даже очевидных форм его можно сопоставить минимум с 17-ю (!) совершенно другими заболеваниями.
Даже "понятный" муковисцидоз - "проскакивает" через фильтры проверок на всех уровнях... Всё не так просто!
По нашим многолетним наблюдениям - каждый житель России из числа условно здоровых - является носителем 4-6 наследуемых заболеваний,
при этом даже не подозревая об этом (сам родитель не болеет, но его дети могут родиться больными с вероятностью от 25 до 100%
в зависимости от вида и формы заболевания и состояния генома второго родителя-партнера)
- 5-11 заболеваний из 400 / 7 000
- 0,06% выявления вместо 15%
- скрининг по ОМС только с 2006 г.
- 1,5 млн новорожденных в год
- каждый в РФ - носитель 4-6 болезней
15% всех деток - страдает от наследуемых заболеваний, из них 2% - в тяжелой форме, 6% - значительно ограничены в возможностях,
у 7% изначально снижен жизненный потенциал;
85% других детей - половина из них нездорова, все без исключений - носители патологий, у каждого 5-го из них будет больное потомство!
Диагностика вырожденных заболеваний
какие есть нюансы:
Сверхвариативная клиническая картина - одно и то же заболевание может:
проявляться в разное время жизни (в первые 3 дня, в 5 мес., в 2 года и т.п.)
развиваться с разной скоростью (в таком-то кейсе - до тяжелой стадии - за 7 мес., в другом - за 3 года, и т.п.)
быть гетерогенным по природе (зависеть сразу от 50 генов, иметь 4 кардинально разных механизма и т.д.)
передаваться одновременно ВСЕМИ возможными путями наследования, без единого шаблона
совершенно по-разному отражаться на фенотипе (в этом случае - есть сухость кожи, в другом - вообще нет)
демонстрировать одни и те же симптомы с абсолютно другим поражением (пример - 56% всех
подобных патологий - имеют неврологические проявления - судороги/спазмы...)
показывать неочевидные клинические картины на детальном уровне проявления...
Одновременное наличие нескольких
«поломок», взаимно влияющих друг
на друга на уровне клинических
проявлений (эффект суперпозиции)
Симптомы заболевания идентичны
или сходны с симптомами другого
заболевания (эффект мимикрии)
Отсутствие клинической картины
по одному из наследственных заболеваний на фоне проявления другого заболевания (эффект маскировки)
Сложность выявления и "коварство" большинства наследуемых заболеваний - на нескольких примерах:
(поэтому к нам приходят, как правило, после многих бесплодных анализов или позже, чем стоило бы)
![](../assets/images/dist/ydvbd-ab2.webp)
![](../assets/images/dist/ydvbd-ab3.webp)
![](../assets/images/dist/ydvbd-ab4.webp)
В зависимости от ситуации, для установления диагноза по врожденному заболеванию у ребенка могут применяться следующие виды генетических исследований:
Секвенирование по Сэнгеру для семьи (группа родственников 1-3 исследуемых («трио»), за 1 участок
стоимость исследования
667 BYN
срок проведения
до 35 дней
Секвенирование
митохондриальной ДНК
стоимость исследования
717 BYN
срок проведения
до 15 дней
Молекулярное кариотипирование для 1 человека (от 50 000 пар нуклеотидов)
стоимость исследования
900 BYN
срок проведения
до 45 дней
Молекулярное кариотипирование для 1 человека (от 50 000 пар нуклеотидов)
стоимость исследования
1133 BYN
срок проведения
до 15 дней
Молекулярное кариотипирование для 1 человека (от 1 000 пар нуклеотидов)
стоимость исследования
1467 BYN
срок проведения
до 37 дней
Секвенирование по расширенной экзомной панели (одной из требуемых)
стоимость исследования
1167 BYN
срок проведения
до 55 дней
Секвенирование клинического экзома (клинэкзом-секвенирование)
стоимость исследования
1300 BYN
срок проведения
до 60 дней
Секвенирование полного экзома (ПЭС, полноэкзомное секвенирование)
стоимость исследования
1567 BYN
срок проведения
до 60 дней
Полногеномное секвенирование, 30X с интерпретацией
стоимость исследования
3167 BYN
срок проведения
до 70 дней
Указана базовая цена, без учета возможных затрат на логистику биоматериалов и специфики заказа.
Какое исследование нужно в Вашем случае - определяется назначением, врачами в полном контакте с нашими
специалистами - это серьезный вопрос, нужно учесть массу аспектов; в упрощенном виде алгоритм принятия решения - выглядит согласно схеме ниже...
Путь 1: есть достаточно четкие признаки известной хромосомной патологии
молекулярное кариотипирование (хромосомный микроматричный анализ) [МК, ХМА - синонимы]
нет результата: секвенирование по клинической экзомной панели / секвенирование по клиническому экзому
нет результата: полногеномное секвенирование (ПГС, WGS - синонимы)
Путь 2: налицо специфический фенотип, связанный с известной генной патологией
секвенирование по Сэнгеру / секвенирование мтДНК
нет результата: секвенирование по экзомной панели / секвенирование по клиническому экзому / полноэк-зомное секвенирование (ПЭС)
нет результата: полногеномное секвенирование (ПГС, WGS - синонимы)
Путь 3: смешанная, неочевидная, вариативная, множественная клиническая картина
секвенирование по одной из 3 "типовых" клинических экзомных панелей ("Неврологическая", "БОВ", "УО и РАС")
нет результата: полноэкзомное секвенирование (ПЭС)
нет результата: полногеномное секвенирование (ПГС, WGS - синонимы)
Почему полногеномное секвенирование - топовое исследование?
1. Рассматривает все 3 типа поражений - проверка проводится и по кариотипу (хромосомные патологии), и по митохондриальному геному (митохондриальные патологии), и по основному геному (генные патологии)
2. Выявляет инсерции и делеции даже от одного нуклеотида, однонуклеотидные замены, тринуклеотидные повторы, CNV любого размера (итог несбалансированных хромосомных перестроек - делеций и дупликаций, влияющих на предрасположенность к возникновению заболеваний)
3. Детектирует сбалансированные перестройки (в т.ч. определяет их координаты), участки с потерей гетерозиготности (LOH, наследственная и иные формы онкологических поражений), точки формирования однородительской дисомии (ОРД), любые структурные вариации в некодирующих областях (интронах, регуляторных межгенных участках, нетранслируемых регионах, сайтах сплайсинга и др.)
4. Делается один раз, его формат позволяет впоследствии проводить многократные "дорасследования" при необходимости (возможен пересмотр и через годы, по факту дополнения информационных баз прикладной генетики) - патогенные и вероятно патогенные варианты можно всегда перепроверить, уточнить, и т.п.
1. Рассматривает все 3 типа поражений - проверка проводится и по кариотипу (хромосомные патологии), и по митохондриальному геному (митохондриальные патологии), и по основному геному (генные патологии)
2. Выявляет инсерции и делеции даже от одного нуклеотида, однонуклеотидные замены, тринуклеотидные повторы, CNV любого размера (итог несбалансированных хромосомных перестроек - делеций и дупликаций, влияющих на предрасположенность к возникновению заболеваний)
3. Детектирует сбалансированные перестройки (в т.ч. определяет их координаты), участки с потерей гетерозиготности (LOH, наследственная и иные формы онкологических поражений), точки формирования однородительской дисомии (ОРД), любые структурные вариации в некодирующих областях (интронах, регуляторных межгенных участках, нетранслируемых регионах, сайтах сплайсинга и др.)
4. Делается один раз, его формат позволяет впоследствии проводить многократные "дорасследования" при необходимости (возможен пересмотр и через годы, по факту дополнения информационных баз прикладной генетики) - патогенные и вероятно патогенные варианты можно всегда перепроверить, уточнить, и т.п.
Неверно выбранное исследование - приведет к потере драгоценного времени, трате средств впустую - поэтому решение по методу исследования
принимается врачом, понятное, но не всегда уместное желание родителей сэкономить - как никогда чревато... Довольно часто выгоднее заплатить
за ПЭС, чем через 5 лет пытаться вывезти ребенка на трансплантацию костного мозга в клинику в Израиле, экстренно собирая через соцсети Х миллионов
на операцию, не имея запаса по времени... (лучше же всего вообще - обдуманно планировать беременность, проверять совместимость родителей на генетическом
уровне ЗАРАНЕЕ, выявлять носительство заболеваний до зачатия...особенно понимая факты, изложенные выше...разумнее, ответственнее и
дешевле - предотвратить и не допустить, чем в спешке пытаться решить крайне тяжелую задачу). Предлагать делать всем подряд полногеномное
секвенирование - далеко не всегда верно, это такая же крайность, как и секвенирование по панели из 2 генов при сценарии №3 - истина,
как всегда - в поиске баланса, подборе оптимального и обоснованного решения, в опоре на знания профессионалов
Как бы ни было сложно - мы сможем провести тщательное исследование, установить четкий диагноз,
даже в самом неочевидном случае - справимся и будем рады помочь!